崇祯六年八月初三，第二批清国的征日派遣军出发了。
经过清国内部的磋商，这一次带队的是代善，兵力是两黄旗和蒙古兵，此外还有一批用于建立政权的官员和普通民众，总数达到了一万多人。
占领日本的前景已经明朗了，日后，日本领土将取代现在的辽东，成为清国的领地，因此也就没有什么可以犹豫的了。皇太极派出自己最信任的代善就势所必然。本来还有一个人选，那就是处于世子地位的豪格，但是，考虑到多尔衮的威望和能力，豪格不足以震慑多尔衮而取得领导地位，所以不能考虑豪格，只能是代善。
多尔衮要求增兵，并希望两白旗全部过去，被皇太极否决了，皇太极不得不提防着多尔衮的野心，所以这一次出动的就是正黄旗、镶黄旗各2000人的部队，两黄旗是皇太极的嫡系部队。另外又从科尔沁调2000蒙古兵，合计就是6000人的部队，九州的派遣军将累计达到一万二千人。
为了平衡多尔衮的情绪，两白旗的民众选出4000人，加上两黄旗的民众2000人，还有科尔沁蒙古打头站的1000民众，这又是7000人。所以这一次的运输总量是一万多人，为了安全和运输途中舒适一些，这些人将分两批运送，第一批运输部队，第二批运送民众。
此外清国抽调了100多名官员将跟随第一批运送过去。这100名官员中有三分之二是汉人。
关于汉人的事情已经达成了协议，因此，在金州码头，国防军也要例行公事的进行审查，挨个的询问是否自愿追随清国，并且要具名画押。这种审查就是避免胁迫，多少能起到一些作用。
本来15艘商船足够使用，但是这一批人，无论是鞑子部队还是平民都携带了大量的物资，这也难怪，他们这就是搬家，家中的细软、贵重物品都随身携带着，如果不是规定了不准带家具的话，恐怕运输量还要大。所以这个运输队就有20艘大型商船，护卫的舰只是一艘护卫舰、两艘炮舰。
这期间多尔衮也没闲着，他的部队几乎每日出击，九州岛北部的平原地带已经完全占领。一旦遇到难于进攻的堡垒，他们也不会强行进攻，而是找国防军团寻求火炮支援，这种打法当然是攻无不克战无不胜了。多尔衮的减丁政策被彻底的执行，杀红了眼的鞑子兵们几乎是见人就杀，之所以造成这种情况也是日本人的反抗所致。日本的女人留下的还是比较多，一方面是因为女人反抗的力度小，另外鞑子们也需要女人来泄欲，再有就是总要有一些劳务活计需要人们去做，于是日本的年轻女人们就充当了免费的劳动力。
由于清国的平民还没有来到，所以除了重要的城镇驻扎一些部队之外，村庄、小的集镇清军并没有派人驻扎，只是不停的扫荡。抢光、杀光的两光政策不断的在北九州大地上上演。
相对中国的幅员辽阔，日本还是太狭窄了，北九州的这个小平原，最长的长度不过六七十里，巴掌大的地方已经让鞑子们翻了个底朝天，反反复复地杀了无数遍。
清军的下一个目标是福冈，再下一个是久留米，这两个地方拿下来之后，九州岛的北部就完全占领了。
国防军的海军派遣军同样也没有闲着，他们带着一批鞑子兵在九州岛的北部扫荡那些近海的岛屿，没有人的小岛看一看就算了，有价值的岛屿都要登岛扫荡，然后派军驻守，缴获的日本船只就分配给这些驻岛的守军做交通船使用。还要派出专人教鞑子驾驶船只，这些骑惯了马的鞑子们，很少有会用船的。
这期间多尔衮收到了朱万化的一个电报，要求从他手中得到一批日本女人充作移民，首批数量大约一万人，年龄要求15到25岁之间，以后根据需要还会陆续补充数量。朱万化说绝对不会让清国吃亏，会在其他方面给予补偿，这是移民交换，绝对不是买卖人口。
多尔衮猜测国防军是不是建妓院或者供部队使用，这个猜测是错误的，朱万化的目的是处置那批从汉中转运来的乱民战俘，准备让他们去开发巴布亚、新西兰、澳洲使用的，总不能让这一群乱民打一辈子光棍吧，他们也是要繁衍后代的，没有后代政权如何巩固？
现在这批人都已经到了台湾，执行关押和做苦工。台湾的南北铁路已经修了一年，差不多完工一半了，铁路工地正需要大批的劳动力。
那些乱民的首领们还是有一些优惠待遇的，他们没有去做苦力。原因之一是怕他们煽动闹事，其二是，既然想利用他们，就要进行一些必要的教育。教育的内容以伦理道德和佛教的教化为主，起码要有基本的道德观念。其次，灌输大中华的思想，将来到了海外，最低限度不要与大明为敌。最后就是一些农业的基本知识，要让他们懂得生产，到了海外，以抢劫为生是不能持久的，需要自己生产粮食布匹，维持最基本的需求。
只有完成了最基本的道德、生产技能的训练，才可以放他们走上一条新生之路。
八月初六，代善带队的六千清军和一批以范文程为首的行政官员到达了北九州，阿济格也同船返回。代善的到来自然就取代了多尔衮成为清国派遣军的最高指挥官。
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